Poderse se pueden poner, porque las barras longitudinales del coche están ahí, con y sin techo panorámico. Entiendo que las barras que vende Cupra serán, además, compatibles con el uso del techo. El resto de barras, es cuestión de estudiar las dimensiones.
Esas Thule tienen muy buena pinta, pero parecen muy bajas (muy pegadas a la carrocería), podría interferir con el mecanismo del techo.
Intenta conseguir un plano de las barras y toma medidas en el coche de lo que sube el techo cuando se abre, o comparar ésto último con las de otro coche que sí sepas que es compatible.
Lo que también hay que tener en cuenta es que las barras del Formentor NO SON PARALELAS, no sé si esto es habitual o no en el resto de coches, pero yo he reutilizado las barras que tenía en mi antiguo Qashqai y aluciné a la corrección de longitud que tuve que hacer a la barra de atrás respecto a la de delante: más de media docena de cm más corta.